MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016035	GATC	2	8	25	32	25 %	25 %	25 %	25 %	347825840
2	NC_016035	ATT	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825840
3	NC_016035	GTG	2	6	140	145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347825840
4	NC_016035	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	347825840
5	NC_016035	GGC	2	6	236	241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347825840
6	NC_016035	TAC	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347825840
7	NC_016035	TTG	2	6	355	360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347825840
8	NC_016035	A	6	6	412	417	100 %	0 %	0 %	0 %	347825840
9	NC_016035	TTG	2	6	430	435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347825840
10	NC_016035	CAC	2	6	493	498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347825840
11	NC_016035	TAA	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347825840
12	NC_016035	TGA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825840
13	NC_016035	G	6	6	802	807	0 %	0 %	100 %	0 %	347825840
14	NC_016035	GAAA	2	8	813	820	75 %	0 %	25 %	0 %	347825840
15	NC_016035	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347825840
16	NC_016035	TGA	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825840
17	NC_016035	AGT	2	6	900	905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825840
18	NC_016035	TTG	2	6	914	919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347825840
19	NC_016035	ATT	2	6	944	949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825840
20	NC_016035	AAT	2	6	1045	1050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347825841
21	NC_016035	T	6	6	1099	1104	0 %	100 %	0 %	0 %	347825841
22	NC_016035	TAT	2	6	1131	1136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825841
23	NC_016035	TTA	2	6	1137	1142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825841
24	NC_016035	TTG	2	6	1175	1180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347825841
25	NC_016035	T	6	6	1207	1212	0 %	100 %	0 %	0 %	347825841
26	NC_016035	TTA	2	6	1223	1228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825841
27	NC_016035	T	6	6	1232	1237	0 %	100 %	0 %	0 %	347825841
28	NC_016035	TAT	2	6	1310	1315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825841
29	NC_016035	TTTGGA	2	12	1344	1355	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347825841
30	NC_016035	TGA	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825841
31	NC_016035	ACA	2	6	1472	1477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347825841
32	NC_016035	GA	3	6	1490	1495	50 %	0 %	50 %	0 %	347825841
33	NC_016035	AGTA	2	8	1519	1526	50 %	25 %	25 %	0 %	347825841
34	NC_016035	TGGT	2	8	1766	1773	0 %	50 %	50 %	0 %	347825842
35	NC_016035	AATG	2	8	1957	1964	50 %	25 %	25 %	0 %	347825842
36	NC_016035	CGG	2	6	2003	2008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347825842
37	NC_016035	GAA	2	6	2065	2070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347825842
38	NC_016035	TGA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825842
39	NC_016035	CATATG	2	12	2113	2124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347825842
40	NC_016035	TGA	3	9	2139	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825842
41	NC_016035	ACA	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347825842
42	NC_016035	GCA	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347825842
43	NC_016035	AGC	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347825842
44	NC_016035	TCG	2	6	2610	2615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347825842
45	NC_016035	CTT	2	6	2667	2672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347825842
46	NC_016035	AAGT	2	8	2700	2707	50 %	25 %	25 %	0 %	347825842
47	NC_016035	A	6	6	2740	2745	100 %	0 %	0 %	0 %	347825842
48	NC_016035	ACA	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347825842
49	NC_016035	TGA	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825842

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.